故事发生在遥远的未来，肆虐的异(yì )生兽给人(rén )类的安全带来了巨大的(de )困扰，为了(le )抵挡异兽的进攻，日本政府成(chéng )立了防卫组(zǔ )织TLT，其中，夜袭队拥有(yǒu )着最强大的实力和最强劲的武器，是整个组织内部的中坚力量。　　然而，面对经过了进化的新型异生兽(shòu )，夜袭队亦束手无策，在这个节骨眼上，光之巨人奈克瑟斯奥特曼和它的适能者姫矢准（桐岛优介 饰）出现了(le )。在奈克瑟(sè )斯奥特曼创造出的美塔领域中，奥特曼和异兽之间展开了激烈的斗争。孤门一(yī )辉（川久保拓司 饰）是TLT里的新进成员，当他目睹了奈克瑟斯奥特曼强大(dà )的力量后，开始对奥特曼的起源和姬矢准的神秘过往产生了兴趣。